045331 Environmental Microbiology

Details
Department of Ecology
Earliest Possible Year4 to 6
Duration1 semester
 
Credits6 (ECTS)
Course LevelBSc
 
Examinationwritten examination


Aid allowed

Description of Examination: 13-point scale, internal examiner

Dates of Exam:
 
Organisation of Teaching1 skemamodul pr. uge
 
Block PlacementF3, forår
 
Teaching LanguageDanish
 
Optional Prerequisites045320 Microbiology
 
Course Objectives
Kurset giver et grundigt kendskab til mikroorganismers forekomst, aktivitet og vækst i naturlige miljøer. Kurset vil gøre de studerende i stand til at:
- Forstå betydningen af mikroorganismer for omsætning af organisk stof, fremmedstoffer, tungmetaller, mv. i jordbunden og vandmiljøet.
- Vurdere brugen af mikroorganismer til fjernelse af miljøfremmede stoffer, vækststimulering og sygdomsbeskyttelse af planteafgrøder, samt produktion af industrielle produkter som f.eks. detergenter og enzymer.

 
Course Contents
Udledning af organisk stof, næringsstoffer, toksiske stoffer og en lang række fremmedstoffer (olieprodukter, pesticider, tungmetaller, mv.) påvirker vores naturlige jord- og vandmiljøer. Da mikroorganismerne spiller den afgørende rolle for stofomsætningen og stofkredsløbene i de naturlige miljøer, er det afgørende at forstå
. hvordan stofomsætningen er sammensat af et stort antal delprocesser
. hvordan mange forskellige mikroorganismer bidrager
. hvordan omsætningen varierer i rum og tid og
. hvordan processerne - helt ned på genetisk niveau - reguleres af de naturlige miljøfaktorer.
Med nye og stigende muligheder for at kontrollere og anvende naturligt forekommende mikroorganismer til aktiv miljøbeskyttelse, f.eks. jordrensning, og til vækstfremme og sygdomsbeskyttelse af planterne, er det på samme måde vigtigt at forstå, hvordan tilsætning af specifikke mikroorganismer, valg af dyrkningssystemer og jordbehandling, mv. påvirker de opnåede resultater. For at kunne vurdere evt. risici ved de nye teknologier, er det selvfølgelig vigtigt at undersøge spredningen og overlevelsen af mikroorganismerne, før de udsættes til miljøet. De klassiske og de nye problemstillinger mht. mikroorganismernes rolle i naturens stofomsætning kan i dag belyses med mange metoder. Således er det muligt at studere de enkelte cellers skæbne, fysiologiske tilstand og aktivitet, samt deres effekt på andre organismer i miljøerne i langt større detaljeringsgrad end hidtil. Under kurset vil deltagerne få indsigt i en række af de nye metoder og se eksempler på deres anvendelse inden for den moderne mikrobiologi.

Under forelæsningerne gennemgås de vigtigste grupper af mikroorganismer i relation til deres betydning i danske jord- og vandmiljøer. Vigtige processer gennemgås med henblik på forståelse af både den enzymatiske og genetiske regulering af aktiviteten. En række anvendelser af mikroorganismer i naturlige miljøer vil eksemplificere de nye, moderne teknologier.
Under kollokvierne gennemgås teorien bag de traditionelle og molekylære metoder til påvisning af specifikke mikroorganismer og deres aktivitet, samt vækst i komplekse, naturlige miljøer. Følgende metoder til bestemmelse af bakteriernes aktivitet, mv. vil blive behandlet mere dybtgående under kollokvierne: Påvisning af bakterier ved hjælp af antistof- og markørgenteknikker. Bestemmelse af bakteriers aktivitet ved fluorescens-teknik. Måling af bakteriers vækstrater ved DNA- eller proteinsyntese.
Bestemmelse af bakteriers reaktion på tilført næring eller toksiske stoffer ved isotopteknik og biosensorer.
 
Teaching And Learning Methods
Forelæsninger og kollokvier. Materialet til kollokvierne vil dels være den anvendte lærebog og dels originale artikler.
 
Course Litterature
Maier, R.M., Pepper, I.L. & Gerba, C.P.: Environmental Microbiology. Academic Press 2000. ISBN 0-12-497570-4
 
Course Coordinator
Jan Sørensen, jan@life.ku.dk, Department of Agriculture and Ecology/Section of Genetics and Microbiology, Phone: 35332626
 
Study Board
Study Committee NSN
 
Course Scope
lectures26
Colloquia26

52