| Department of Ecology | |||||||||||||||
| Earliest Possible Year | |||||||||||||||
| Duration | 1 semester | ||||||||||||||
| Credits | 6 (ECTS) | ||||||||||||||
| Course Level | Joint BSc and MSc | ||||||||||||||
| Examination | evaluation of project report No aid allowed Description of Examination: pass/fail, internal examiner | ||||||||||||||
| Organisation of Teaching | |||||||||||||||
| Block Placement | 3-ugers kursus januar | ||||||||||||||
| Teaching Language | Danish | ||||||||||||||
| Optional Prerequisites | 045319 | ||||||||||||||
| Restrictions | 18 | ||||||||||||||
| Course Objectives | |||||||||||||||
| Kursets målsætning er at give deltagerne viden om bakteriers fysiologi og genetik. Hovedvægten er lagt på at opnå praktisk erfaring med vigtige metoder, der anvendes indenfor området. Kurset henvender sig især til studerende, der forventer at komme til at arbejde praktisk med molekylær mikrobiologi indenfor fødevare- eller miljøsektoren. | |||||||||||||||
| Course Contents | |||||||||||||||
| På kurset arbejdes praktisk med en række bredt anvendelige teknikker til at påvise bakterier, overføre DNA mellem bakterier, studere deres genekspression og undersøge deres vækstaktivitet. Vi bruger fluorescent in situ hybridisation og markør-gen teknikker til at mærke bestemte bakterier, så de kan genfindes i komplekse prøver. Desuden isolerer vi plasmid DNA, fremstiller kompetente celler, og overfører plasmid DNA til bakterier ved transformation. Overførsel af plasmid DNA ved konjugation indøves i sammenhæng med transposon mutagenese DNA-hybridiserings og PCR teknikker anvender vi til at påvise bestemte gener i bakterier. Ændring i genekspression undersøges med rapportørgen-teknikker, hvor en genetisk mærket bakterie udsender bioluminescens (lys) når vækstbetingelserne ændres. Ændringer i genekspression studeres tillige på proteinniveau med immunkemiske teknikker. Endelig arbejdes der med isotopmetoder til at undersøge bakteriers vækstaktivitet. | |||||||||||||||
| Teaching And Learning Methods | |||||||||||||||
| Kurset lægger hovedvægten på det praktiske laboratoriearbejde som gennemføres i kursets første 2 uger af hold på 2-3 studerende. Kurset omfatter også teoretiske oplæg til øvelserne, hvor metodernes princip gennemgåes. Desuden afholdes en lille seminarrække, hvor KVL-ansatte eller gæster udefra fortæller om deres forskning, som anvender de metoder vi arbejder med i kurset. I kursets tredie uge udarbejdes rapporter over det praktiske arbejde. Rapporterne inddrager også den udleverede litteratur. Ved kursets afslutning fremlægger de enkelte hold deres rapporter. | |||||||||||||||
| Course Litterature | |||||||||||||||
| L. Jensen, N.O.G. Jørgensen, B. Koch,O. Nybroe og A. Tom-Petersen (2003): Mikrobiel Fysiologi og Genetik. (Købes på Institut for Økologi). Udleveret litteratur. | |||||||||||||||
| Course Coordinator | |||||||||||||||
| Ole Nybroe, oln@life.ku.dk, Department of Agriculture and Ecology/Section of Genetics and Microbiology, Phone: 35332629 | |||||||||||||||
| Study Board | |||||||||||||||
| Study Committee NSN | |||||||||||||||
| Course Scope | |||||||||||||||
| |||||||||||||||