240044 Environmental Microbiology

Details
Department of Ecology
Earliest Possible YearBSc. 2 year to BSc. 3 year
DurationOne block
 
Credits7.5 (ECTS)
Course LevelJoint BSc and MSc
 
ExaminationFinal Examination

written examination


Written Exam in Lecturehall

All aids allowed

Description of Examination: Bedømmelse af projektarbejde. Sluteksamen: 2-timers skriftlig prøve.

Weight: Mindre projektarbejde under kursusforløb (20%) Skriftlig prøve ved sluteksamen (80%)



13-point scale, internal examiner

Dates of Exam:
14 April 2007
 
Requirement For Attending ExamMinimum 75% fremmøde og aktiv deltagelse ved forelæsninger og kollokvier.
 
Organisation of TeachingForelæsninger og kollokvier. Mindre projektarbejde i grupper af ca. 4-6 studerende.
 
Block PlacementBlok 3
Week Structure: A
 
Teaching LanguageDanish
 
Optional PrerequisitesMikrobiologi
 
Areas of Competence the Course Will Address
Kompetencer inden for grundvidenskab:
Kendskab til mikrobielle samfund og vigtige typer af mikroorganismer i naturlige miljøer.
Viden om mikroorganismernes aktivitet og betydning for stofkredsløb, nedbrydning og balancer i naturen.

Kompetencer inden for teknologi og produktion:
Kendskab til klassiske og moderne metoder til detektion af populationer og enkeltorganismer i komplekse miljøprøver.
Viden om metoder til måling af mikroorganismernes aktivitet i naturen.

Kompetencer inden for etik og værdier:
Reflekterer over eksperimentelle data og original tekster inden for faget.
Kan diskutere aktuelle miljøproblemer med mikrobiologisk baggrund.
 
Course Objectives
Målet er at give de studerende en grundig indsigt i mikroorganismernes forekomst, aktivitet og vækst i naturlige miljøer. Indsigten vil rumme et kendskab til de vigtigste grupper af mikroorganismer og deres betydning for omsætning af organisk stof, fremmedstoffer, tungmetaller, mv. i jordbunden og vandmiljøet. Desuden opnås kendskab til miljøeffekter i mikrobiolgiske processer og samfund, samt til praktisk brug af mikroorganismer til fjernelse af miljøfremmede stoffer i naturen.
 
Course Contents
Under forelæsninger gennemgås de vigtigste grupper af mikroorganismer i relation til deres betydning i danske jord- og vandmiljøer. Vigtige processer gennemgås med henblik på både den genetiske og enzymatiske regulering af aktiviteten. En række anvendelser af mikroorganismer i naturlige miljøer vil eksemplificere både de klassiske og nye, moderne teknologier.

Under kollokvier gennemgås teorien bag de traditionelle og molekylære metoder til påvisning af specifikke mikroorganismer og deres aktivitet, samt vækst i komplekse, naturlige miljøer. Følgende metoder til bestemmelse af bakteriernes aktivitet, mv. vil blive behandlet mere dybtgående under kollokvierne: Påvisning af bakterier vha. antistof- og markørgen-teknikker. Bestemmelse af bakteriers aktivitet med fluorescens-teknik. Måling af bakteriers vækstrater ved DNA- eller proteinsyntese. Bestemmelse af bakteriernes reaktion på tilført næring eller toksiske stoffer ved isotop-teknik og biosensorer.

I gruppe-baseret projektundervisning(à 4-6 studerende), indøves formuleringen af en miljømæssig problemstilling med mikrobiologisk indhold. Baseret på den parallelle basisundervisning og individuel litteratursøgning søges og beskrives en mikrobiologisk forklaring, løsningsmodel, o.a. på problemstillingen. Endelig indøves gennem fremstilling af en poster/slide præsentation en mundtlig fremstilling af miljøprojektet, baseret på mikrobiologisk terminologi og argumentation.
 
Teaching And Learning Methods
Indledende, fælles forelæsninger hhv. kollokvier understøtter en gruppe-baseret, projektorienteret undervisning. I undervisningsforløbet indøves således både en platform af basale og metodemæssige kundskaber og et projektorienteret forløb med problemformulering, litteratursøgning og data bearbejdelse, rapportskrivning inkl. data tolkning, diskussion og perspektivering. Gruppernes projekt afsluttes med mundtlig præsentation og fælles evaluering.
 
Course Litterature
Materialet til forelæsninger og kollokvier vil være:

Lærebog: Maier, R.M., Pepper, I.L. and Gerba, C.P.: Environmental Microbiology. Academic Press. ISBN 0-12-497570-4.

Forelæsningsnoter (udlagt på Campusnet)

Originale artikler (udlagt på Campusnet)
 
Course Coordinator
Jan Sørensen, jan@life.ku.dk, Department of Agriculture and Ecology/Section of Genetics and Microbiology, Phone: 35332626
 
Study Board
Study Committee NSN
 
Course Scope
lectures26
Colloquia26
project work75
preparation77
examination2

206