240044 Environmental Microbiology

Details
Department of Agriculture and Ecology
Earliest Possible YearBSc. 2 year to BSc. 3 year
DurationOne block
 
Credits7.5 (ECTS)
Course LevelBSc
 
ExaminationFinal Examination

written examination


Written Exam in Lecturehall

All aids allowed

Description of Examination: Bedømmelse af projektarbejde. Sluteksamen: 2-timers skriftlig prøve.

Weight: Mindre projektarbejde under kursusforløb (20%; hver studerende skal udspecificere sit bidrag til projektarbejdet). Skriftlig prøve ved sluteksamen (80%)



7-point scale, internal examiner

Dates of Exam:
04 April 2009
 
Requirement For Attending ExamAfleveret projektarbejde.
 
Organisation of TeachingForelæsninger, kollokvier og laboratorieøvelser. Mindre projektarbejde i grupper af ca. 4-6 studerende.
 
Block PlacementBlok 3
Week Structure: A
 
Teaching LanguageDanish
 
Mandatory Prerequisites240025 Microbiology
Mikrobiologi (eller lign. basiskursus i mikrobiologi)
 
RestrictionsIngen
 
Course Contents
Kurset er, bl.a. med sin metodemæssige basis, et vigtigt redskabsfag for efterfølgende og videregående studier af mikroorganismerne og deres betydning inden for miljø- og naturressource, samt plantevidenskaberne.

Under forelæsninger gennemgås de vigtigste grupper af mikroorganismer i relation til deres betydning i danske jord- og vandmiljøer. Vigtige processer gennemgås med henblik på både den genetiske og enzymatiske regulering af aktiviteten. En række anvendelser af mikroorganismer i naturlige miljøer vil eksemplificere både de klassiske og nye, moderne teknologier.

Under kollokvier indøves en kritisk vurdering af flere forskellige typer af faglitteratur, såsom fagbøger, videnskabelige tidsskrifter, populære artikler og miljørapporter. Der indøves kritisk datatolkning, baseret på tekst- og figureksempler - og der øves i grundig, faglig diskussion, konklusion og perspektivering.

Under laboratorieøvelser gennemgås og indøves metoder som fluorescens mikroskopi af DNA-farvede bakteriepopulationer og påvisning af enkeltceller af specifikke bakteriegrupper med antistof-, GFP- (Green Fluorescent Protein) eller FISH- (Fluorescent In Situ Hybridization) farvning i naturlige prøver fra vand- eller jordmiljøer.

I gruppe-baseret projektundervisning(à 4-6 studerende), indøves formuleringen af en miljømæssig problemstilling med mikrobiologisk indhold. Baseret på den parallelle basisundervisning og individuel litteratursøgning søges og beskrives en mikrobiologisk forklaring, løsningsmodel, o.a. på problemstillingen. Endelig indøves gennem fremstilling af en poster/slide præsentation en mundtlig fremstilling af miljøprojektet, baseret på mikrobiologisk terminologi og argumentation.
 
Teaching And Learning Methods
Fælles forelæsninger, kollokvier og laboratorieøvelser understøtter en gruppe-baseret, projektorienteret undervisning. I undervisningsforløbet indøves således både en platform af basale og metodemæssige kundskaber og et projektorienteret forløb med problemformulering, litteratursøgning og data bearbejdelse, rapportskrivning inkl. data tolkning, diskussion og perspektivering. Gruppernes projekt afsluttes med mundtlig præsentation og fælles evaluering.
 
Learning Outcome
Viden:
- beskrive nøgleprincipper for antal og sammensætning af bakterier og mikrosvampe i deres naturlige miljø som jord- og vandmiljøer
- beskrive nøgleprincipper for mikroorganismernes indvirkning på stofomsætning og -kredsløb i naturen
- referere kvantitative og kvalitative metoder til påvisning af mikroorganismerne jord- og vandmiljøer
- referere metoder til detektion af specifikke organismer (bakteriestammer) inklusive organismernes metabolisme og vækst i miljøprøver

Færdigheder
- analysere og identificere miljøfaktorernes indvirkning på mikroorganismernes aktivitet og vækst i specifikke miljøer
- analysere og identificere mekanismerne bag mikroorganismernes indbyrdes samspil, f.eks. ved symbiose, konkurrence og prædation
- formidle viden om og metoder til påvisning af mikroorganismer og deres rolle i jord og vandmiljøer

Kompetencer
- udvælge og begrunde anvendelsen af basale og avancerede metoder til undersøgelse af mikroorganismer i komplekse naturprøver
- analysere og diskutere mikroorganismernes samspil og påvirkning af stofomsætningen i deres miljø
- arbejde selvstændigt i en gruppe og herunder tilegne sig ny viden om metoder til beskrivelse af mikroorganismer, deres metabolisme og indbyrdes samspil
 
Course Litterature
Materialet til forelæsninger og kollokvier vil være:

Lærebog: Maier, R.M., Pepper, I.L. and Gerba, C.P.: Environmental Microbiology. Academic Press. ISBN 0-12-497570-4.

Forelæsningsnoter (udlagt på Campusnet)

Originale artikler (udlagt på Campusnet)
 
Course Coordinator
Jan Sørensen, jan@life.ku.dk, Department of Agriculture and Ecology/Section of Genetics and Microbiology, Phone: 35332626
 
Study Board
Study Committee NSN
 
Course Scope
lectures26
Colloquia22
practicals20
project work60
preparation76
examination2

206